Вплив на зерно пліснявих грибів, самозігрівання зерна, пошкодження комахами, кліщами, поїдання гризунами — є факторами недбайливого господарювання. Втрати під час зберігання на складі не повинні перевищувати встановлені норми природних втрат зерна.

Погіршення якості зерна під час зберігання може відбуватися від самозігрівання. Цей процес зумовлений недотриманням норм, щодо зберігання зерна. Уникнути негативного впливу від самозігрівання можна за умови підтримання оптимального режиму зберігання. Адже коли вологості зерна 16% самонагрівання не спостерігається, а за вологості 18% проходять процеси, які супроводжують активний ріст плісеневих грибів. А якщо вологість зерна 25% то вже на 5 добу температура може сягати 65 ºС і це призведе до катастрофічних наслідків.

Свіжозібране зерно нерідко має підвищену вологість, за рахунок чого інтенсивно дихає, що сприяє його самонагріванню. Цей процес інколи починається через 1–2 години після вивантаження насіння з автомашини, і навіть невеликий ступінь самонагрівання негативно позначається на придатності його до зберігання.
Партії зерна, що хоча б один раз частково самозігрівалися, стають нестійкими під час зберігання навіть за умови усунення даного процесу. Мікрофлора, яка є в наявності, за найменших сприятливих умов знову активізується і швидко призведе до підвищення температури зернової маси. Тож до таких партій необхідно бути більш уважними.

Розвиток процесу самозігрівання (температура підвищується до 33–40 ºС, цей термін триває 3–8 днів) призводить до суттєвих змін якості та властивостей зернової маси. У такому зерні можуть пройти біохімічні перетворення, які сприятимуть скороченню його довговічності та значному погіршенню його якості.

Завжди слід пам’ятати низька вологість поєднана із низькою температурою — ідеальні умови зберігання зерна.